EMMASA desde 2005 cuenta con la Certificación el Sistema de Gestión de Seguridad y Salud en el Trabajo (SST), adaptándolo en 2019 a la Norma Internacional ISO 45001. Este sistema permite una mejora continua para la gestión de sus riesgos para la SST, siendo más eficientes, reduciendo los accidentes, y aumentando la operatividad al disminuir las situaciones de emergencias.